Traditionnellement, le traitement des données de Single Cell incorpore certaines étapes de filtrage et de normalisation avant le regroupement des cellules et l’interprétation en aval. Au lieu de supprimer ces reads in-silico, CRISPRclean les supprime in-vitro avant le séquençage, en redistribuant 50 % des clusters de séquençage vers des transcrits uniques biologiquement pertinents, ce qui vous permet de maximiser l’UMI et la sensibilité des gènes.

CRISPRclean tire parti de la déplétion Cas9 et des guides spécialement conçus pour supprimer les reads qui sont filtrées avant l’analyse secondaire. Le kit CRISPRclean Single Cell RNA Boost vous permet d’éliminer le bruit de fond avec un impact minimal sur votre flux de travail et une confiance maximale dans les résultats de l’analyse séquentielle de l’ARN de la cellule unique.

Points forts

• Obtenez une vision plus approfondie des profils d’expression des cellules individuelles
• Amélioration de 1,5 fois la sensibilité de détection des gènes et des UMI
• Augmentation des données utilisables en réduisant de 50 % les séquençages inutiles
• Supprime les séquences non utilisées pour l’analyse secondaire, y compris les reads non alignées, les gènes ribosomaux, mitochondriaux et non variables.

*Données provenant de PBMC, une certaine variation est attendue avec différents types de cellules.