Human DNA Depletion

Les échantillons de microbiome humain sont souvent constitués d’un mélange d’ADN humain et microbien. Pour certains échantillons, l’ADN humain contaminant peut représenter une proportion si importante des reads que les fragments microbiens sont considérablement inhibés. Le fait de consacrer des reads de séquençage à l’ADN humain contaminant entraîne une diminution de la couverture du génome microbien, une diminution de la résolution de la communauté microbienne et une augmentation des coûts de séquençage. Le kit de déplétion de l’ADN humain utilise une déplétion simple basée sur CRISPR pour couper les molécules humaines indésirables qui sont ensuite éliminées par un traitement à l’exonucléase. Ce kit vous permet de séquencer davantage de reads microbiens à partir de vos échantillons métagénomiques et d’obtenir la vision la plus complète et la plus impartiale du microbiome.

Points forts

– Vue impartiale du microbiome humain

– Suppression spécifique de l’ADN humain à l’aide de CRISPR

– Amélioration de la couverture du génome microbien précédemment « étouffé » par l’ADN humain

– Sensibilité accrue de la détection des espèces microbiennes peu abondantes

Les lectures mitochondriales occupent une grande partie de l’espace de séquençage dans le contexte de certains types d’échantillons et d’applications. En épuisant les lectures mitochondriales avant le séquençage, les lectures de séquençage peuvent être redirigées vers des informations précieuses que les chercheurs peuvent utiliser. Le kit de déplétion de l’ADN mitochondrial DepleteX™️ utilise une simple déplétion basée sur CRISPR pour clivirer et éliminer, avant le séquençage, les molécules humaines indésirables dérivées de l’acide nucléique mitochondrial. Le kit donne aux chercheurs la possibilité de séquencer moins, mais de capturer plus d’informations à partir d’échantillons à haut contenu mitochondrial.