Améliorer la détection microbienne grâce à l’épuisement de l’ADN humain.
Les échantillons de microbiome humain sont souvent constitués d’un mélange d’ADN humain et microbien. Pour certains échantillons, l’ADN humain contaminant peut représenter une proportion si importante des reads que les fragments microbiens sont considérablement inhibés. Le fait de consacrer des reads de séquençage à l’ADN humain contaminant entraîne une diminution de la couverture du génome microbien, une diminution de la résolution de la communauté microbienne et une augmentation des coûts de séquençage. Le kit de déplétion de l’ADN humain utilise une déplétion simple basée sur CRISPR pour couper les molécules humaines indésirables qui sont ensuite éliminées par un traitement à l’exonucléase. Ce kit vous permet de séquencer davantage de reads microbiens à partir de vos échantillons métagénomiques et d’obtenir la vision la plus complète et la plus impartiale du microbiome.
Points forts
– Vue impartiale du microbiome humain
– Suppression spécifique de l’ADN humain à l’aide de CRISPR
– Amélioration de la couverture du génome microbien précédemment « étouffé » par l’ADN humain
– Sensibilité accrue de la détection des espèces microbiennes peu abondantes
