Identifier les transcrits faiblement exprimés grâce au panel de déplétion ciblée de l’ARN pour le tissu hépatique
Nos panels de déplétion d’ARN spécifiques aux tissus CRISPRclean éliminent les transcrits les plus expressifs in-vitro avant le séquençage, redistribuant ~50% des clusters de séquençage à des transcrits uniques biologiquement pertinents – ce qui vous permet de maximiser l’UMI et la sensibilité des gènes.
Maximiser la couverture du séquençage dans le tissu hépatique
Les échantillons d’ARN comportent généralement un grand nombre de transcrits hautement exprimés et bien caractérisés qui surpassent les transcrits faiblement exprimés pour la couverture de séquençage. Le reséquençage de ces transcrits n’apporte que peu d’informations biologiquement pertinentes. Le manque de couverture de séquençage, associé au bruit de fond important des transcrits à forte expression, limite la détection des gènes à faible expression, des variants rares et des événements de fusion uniques qui peuvent être des moteurs de la maladie.
Points forts
– Panel hépatique conçu pour éliminer ~50 % des transcrits exprimés dans un tissu hépatique normal
– Augmentation de la sensibilité de ~50 % pour voir plus de transcrits biologiquement pertinents
– Maximisation de la détection des variants et des isoformes avec moins de séquençage
– S’intègre facilement dans votre flux de travail grâce à un protocole simple et flexible
Le kit contient de l’ARN guide spécifique au tissu hépatique et des réactifs de déplétion pour la déplétion post-library.
Compatible avec CRISPRclean Single Cell RNA Boost (KIT1018) et CRISPRclean RNA Prep HMR (KIT1014)