Nadia fait passer le scRNA-Seq au niveau supérieur en utilisant l’automatisation et la flexibilité pour générer des données Single Cell reproductibles de haute qualité.
L’instrument Nadia est une plateforme microfluidique automatisée à base de gouttelettes pour la recherche sur les cellules uniques qui encapsule jusqu’à 8 échantillons, en parallèle, en moins de 20 minutes. Plus de 50 000 cellules uniques peuvent être capturées par cartouche au cours d’un cycle. Le Nadia, entièrement automatisé, guide les utilisateurs à travers toutes les étapes de manipulation via une interface tactile facile à utiliser.
L’ajout du système Nadia Innovate à l’instrument Nadia le transforme en un système ouvert, pour le développement de nouveaux protocoles et applications.
Dolomite Bio propose également différents kits pour un workflow complet et maitrisé (RNAdia pour le scRNA-Seq, nadAROSE et nadia3D pour l’encapsulation de cellules en agarose et les cultures 3D)
Nadia
Auto
matisation : Encapsulation des échantillons entièrement automatisée
Facilité d’utilisation : Détection automatique des cartouches spécifiques à l’application, interface à écran tactile et guides lumineux pour le chargement des échantillons
Flexible : Présence de différentes cartouches pour traiter 1, 2, 4 ou jusqu’à 8 échantillons en parallèle
Contrôle de la température : Refroidissement automatisé de l’échantillon pour maintenir l’état du transcriptome
Cartouche à usage unique : Cartouches jetables pour éviter toute contamination croisée
Véritablement unicellulaire : Taux de doublets cellulaires ultra bas grâce à une agitation douce des cellules
Logiciel d’analyse Single Cell : Utilisez le logiciel Partek Flow pour analyser de manière transparente les données Nadia, sans aucune expérience préalable en bioinformatique
Nadia Innovate
Nadia Innovate a été conçu spécifiquement pour répondre aux besoins des biologistes qui veulent développer et valider de nouveaux protocoles et applications en Single Cell. Ces besoins comprennent la facilité d’utilisation, la flexibilité pour contrôler tous les aspects de la formation des gouttelettes, un faible coût, un débit élevé et des performances maximales.
Les protocoles nouvellement développés peuvent être transférés sur l’instrument Nadia pour un fonctionnement en parallèle à haut débit. En permettant aux utilisateurs de contrôler des paramètres tels que la taille des gouttelettes, leur fréquence, la température, l’agitation et le temps, l’innovation est débloquée.
Flexibilité : Système ouvert et configurable pour développer de nouveaux protocoles et applications
Protocole transférable : Après optimisation, les conditions expérimentales peuvent être transférées et exécutées sur l’instrument Nadia
Optimisation rapide des protocoles : Réglage défini par l’utilisateur de la taille des gouttelettes, de la fréquence, des composants des gouttelettes, de la température et de l’agitation
Visualisation facile du processus : Microscope à haute vitesse et caméra pour l’observation en temps réel de la formation des gouttelettes
Logiciel PC flexible : ajustements du logiciel en cours d’exécution pour surveiller les nouveaux protocoles et les ajustements de protocoles
Applications et kits disponibles
Single Cell RNA-Seq
Le Single cell RNA-Seq (scRNA Seq) est un outil qui permet un accès simple et robuste aux transcriptomes de milliers de cellules uniques, ce qui donne un aperçu sans précédent des tissus à une résolution de cellule unique. Cela offre des informations vitales sur l’hétérogénéité et la dynamique spécifique des cellules, ce qui est essentiel pour comprendre de nombreuses maladies, l’immunité, le développement, etc…
Avec le kit RNAdia, cela devient un workflow complet, de haute qualité et à faible coût pour le séquençage de cellules uniques:
- Faible coût réactif
- Flexibilité de débit: de quelques centaines à 50 000 cellules
- Haut débit: plus de 50 000 cellules encapsulées par run
- Workflow optimisé: de l’encapsulation à la création des banques d’ADNc en seulement 6 heures
- Processus complet avec le kit RNAdia et le service bioinformatique Dolomite Bio
- Ne nécessite pas de connaissance en bioinformatique: Dolomite Bio peut s’occuper de l’analyse de vos datas
- Compatibilité avec de nombreux types cellulaires
Je télécharge la note d’application du kit RNAdia.
Single Nuclei RNA-Seq
Le Single nuclei RNA-Seq (sNuc-Seq) est une nouvelle méthodologie qui utilise des noyaux isolés au lieu de cellules entières pour établir le profil de l’expression génétique dans des cellules difficiles à isoler, ainsi que dans des tissus archivés. Grâce à la technologie microfluidique des gouttelettes, les utilisateurs peuvent établir le profil de milliers de noyaux à faible coût et à haut débit.
Plant Protoplast RNA-Seq
Le Single cell RNA-Seq (scRNA-Seq) est un outil qui permet un accès simple et robuste aux transcriptomes de milliers de cellules uniques. Avec Plant Protoplast RNA-Seq (ppRNA-Seq), Dolomite Bio propose désormais une application standardisée spécifique aux besoins des cellules végétales.
Encapsulation de cellules en Hydrogel pour analyses cellulaires
Que sont les hydrogels ?
Les hydrogels sont des matériaux semi-solides composés d’un réseau de polymères hydrophiles insolubles qui absorbent l’eau. Les hydrogels peuvent être d’origine naturelle, comme l’agarose, l’acrylamide ou le collagène, ou synthétisés chimiquement, comme le polyéthylène glycol.
Les hydrogels dans la recherche Single Cell, quelles sont les applications?
Les hydrogels peuvent fournir des structures appelées Scaffolds en phase solide pour les cellules tout en permettant la diffusion des nutriments et des gaz dissous. Par conséquent, les cellules encapsulées dans les scaffolds d’hydrogel peuvent rester viables pendant de longues périodes ou même proliférer dans la matrice d’hydrogel, ce qui fait de l’encapsulation de cellules dans des hydrogels un outil polyvalent pour comprendre les systèmes biologiques.
L’encapsulation de cellules dans des scaffolds d’hydrogel peut être réalisée sur l’instrument Nadia et de nouveaux protocoles et workflow pour l’encapsulation de cellules dans des hydrogels peuvent être développés et optimisés avec Nadia Innovate.
Quels sont les kits disponibles?
nadAROSE: Le scaffold d’agarose et sa capacité à permettre la diffusion de nutriments et de gaz en font un système idéal pour les études de cellules vivantes de mammifères et de non-mammifères, étant donné ses nombreuses similitudes avec l’environnement physiologique natif des cellules vivantes. Les cellules uniques encapsulées dans l’agarose peuvent donc être maintenues pendant de longues périodes dans ces micro-environnements tridimensionnels individuels et être utilisées dans diverses recherches, notamment des expériences sur des cellules uniques.
Applications:
- Études sur la sécrétion cellulaire
- Interactions cellule-cellule
- Culture de cellules microbiennes
- Compatible avec les analyses cytométriques
nadia3D: le kit nadia3D est un kit complet, standardisé et simplifié pour les workflow de culture cellulaire 3D.
Encapsulez jusqu’à un million de cellules dans des scaffolds à base de collagène en moins de 30 minutes avec l’instrument Nadia.
Grâce à ce kit, les scientifiques peuvent désormais réaliser une culture 3D à haut débit tout en conservant l’identité de chaque cellule et en s’attendant à un taux de perfusion élevé du milieu ou de la substance testée dans et hors de la culture.
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